对于一些小的商铺，根据资产等级不同，按照不同额度进行征税。譬如一些杂货铺、小作坊等地方，资产太少，很多都是农业经济的衍生物。为了促进这些小型商铺发展，一般象征性的收一部分。
而大的饭店、车马行、商队、船队、贸易铺、大型作坊等企业，则分为两部分。一部分为行业准入，根据资产分为三四个等级固定收税，然后再根据不同行业不同的标准，征收增值税。
其实这个年代，想偷税漏税太容易了，很多商业收入、价值官府根本无法估量。一年收入十万钱，很有可能被他瞒报成五千，使得商税失去存在的意义。所以黄明远设置行业准入税，固定收取一部分利润，作为对增值税瞒报漏报的补贴。
黄明远当然知道这样不合理，这样做对于一些中小企业压制很大，但没有办法。为了多收商税，就必须如此。
黄明远又下令辽东各地取消了各种杂七杂八的商业税收，将商税固定下来，避免了各种关卡的吃拿卡要。
黄明远统一入城税和过关税设置，降低征收比例，减轻了一些商铺的经营负担。
总得来说，新的商税使得商人交的钱增多，尤其是一些暴利行业，譬如妓院、戏馆、旅店、车马行、商队、船队，更是要将相当一部分产出交给官府。
但黄明远没有办法，官府要想有钱，必须从税收上下功夫。若是不想进一步剥削普通老百姓，只能将其转嫁到商人头上，这也是无可避免的。
辽东的商业不算发达，是以四海商团为核心，带动周边产业发展的一条商业模式。黄明远下令，四海商团的企业按照税收要求进行缴纳商税之后，其余各家立刻跟进了。各家也不情愿，但没有办法，谁让黄明远狠起来连自己都打。
当然官府中也专门增加了一条偷税漏税罪，算是对各家商团留下了一柄达摩克利斯之剑。
现在的辽东商业并没有发展起来，收到商税还多是四海商团的。对于黄明远来说，相当于左手换到右手，影响不大。众人对此纷纷不解，都是黄明远的钱，费那些劲折腾什么。
黄明远当然不是无意义的折腾，而是放眼于未来。
其实这个年代，普通人若是没有后台，在商业上也不可能做大做强，因为社会环境不允许。些许小产业，官府对其每年的盘剥就比交的商税还要多，商税影响最大的其实就是统治阶级了。
黄明远现在趁着统治阶级的势力在辽东不强，便在辽东提前下手，造成既定事实，形成完备的商税秩序。等到以后即使他们强盛起来，有历史支撑，商税之事也不容易发生变化。
在辽东实行的制度是为了以后推广天下，黄明远准备从辽东开始，然后逐步在幽州、丰州等地实行。等到平定河北的动乱，然后在河北实行。河北现在动乱纷纷，各种势力都在动荡之中，正是改革的最好机会。
打天下容易，治理天下难。若是只是为了争天下，然后却依然遵循旧制，即使当了皇帝又有什么用，让这个国家重新走老路吗？